Elphaba har sedan händelserna i första filmen blivit utnämnd till “Den onda häxan i Väst”, medan Glinda kliver fram som den älskade “Good Witch” och offentlig figur i Oz. Deras tidigare vänskap sätts på prov när de båda måste konfrontera sina nya identiteter, maktspel och konsekvenserna av sina val. Samtidigt hotas Oz av politisk olydnad och revolter.